柑橘黄化脉明病毒福建和浙江分离物的全基因组序列测定及分子特征

柑橘黄化脉明病毒(citimmunotherapeutic targetrus yellow vein clearing virus,CYVCV)是我国柑橘生产上新近发生的一种病毒,侵害柑橘后能够造成严重的经济损失。本研究测定了CYVCV福建和浙江分离物的全基因组序列,并对其分子特征进行研究。结果表明,CYVCV核苷酸全长为7 529～7 531 nts,包含6个开放阅读框(ORF),与CYVCV参考分离物CQ核苷酸序列一致性为98.30%～98.85%。重组分析结果显示,测定的7个CYVCV分离物基因组内未检测到显著的重组信号,但GX-STJ分离物在3 393～6 2Endocrinology & Hormones抑制剂97 nt位置存在重组位点。进一步的系统发育分析表明,所有CYVCV中国分离物聚为一个单系进化枝,印度分离物位于树根附近且selleck JNJ-42756493在多个分枝中有分布,表明CYVCV进化具有较强的地理特异性,其可能起源于印度。本研究明确了CYVCV群体的全基因组序列特征和进化关系,研究结果为该病毒后续的相关研究奠定理论基础。